网络药理学，对于中医研究者来说想必不会陌生。曾经，几个数据库一倒腾，cytoscape软件一顿操作，出几个高（kan）大（bu）上（dong）的图，以几乎零成本、零风险的方式就能发篇2、3分的SCI，轻松搞定毕业的问题。羡慕！但能发文章的都是别人，等到自己做出网络药理学的时候，面临的的是无止境的秒拒。要毕业了，怎么办？看看这个套路能不能助你快速发表更高分的论文。

图片来源：ScientificReports

这篇文章于年1月13号在SCIENTIFICREPORT上发表，影响因子3.9分。虽然该期刊曾一度被列为水刊，但是其认可度在国外还是比较高的，在JCR分区中长期处于综合类1区。而且，在最新发布的期刊预警黑名单中，该期刊并未上榜。

接下来我们来看看这篇文章能发到将近4分，到底有啥“过人之处”。

本文题目为：“基于网络药理学探讨苦参抗炎症反应的分子机制”（把药物和疾病过程换一下是不是和你做的网络药理学一毛一样？）。从题目来看背景清楚：已知苦参有抗炎作用。目的也很明确：探索苦参抗炎的机制。那么我们看下作者是怎么做的：

第一步：从老熟人TCMSP数据库中用OB、DL筛选苦参可能发挥作用的的活性成分，基于文献把漏掉的补充进去。

第二步：从ETCM、STITCH、SEA、SymMap数据库中找活性成分对应的潜在靶标蛋白，取交集，构建成分-靶标网络（图一）。

图一：成分靶标图

图片来源：ScientificReports

第三步：从OMIM、Genecard、NCBI基因数据库找到与炎症反应相关的基因（蛋白）。与药物靶标蛋白取交集，交集蛋白导入STRING数据库构建PPI网络。用cytoscape中的cytoHubba插件找到排名最靠前的基因（炎症因子当仁不让，稳居前列）：图二

图二：PPI网络图

图片来源：ScientificReports

第四步：用cytoscape中的clusterProfiler包做KEGG和GO分析，排名靠前的也是炎症相关的通路（图三），嗯，结果真好。

图三：信号通路图

图片来源：ScientificReports

前面四个步骤就是1分期刊都不要的网络药理学套路咯，接下来作者做了啥高端的事让这这研究上了个档次呢：然并卵。

第五步：接下来作者就开始熬中药，然后加入到炎症细胞模型中，检测了细胞活力，NO活NF-κB核转位以及几个Hub基因的mRNA及蛋白表达（图四），然后就结束啦。是不是很惊（ping）险（ping）刺（wu）激（qi）？

图四：细胞验证

图片来源：ScientificReports

最后，我们回顾一下这篇文章到底说明了什么问题？已知苦参具有抗炎作用→网络药理学发现苦参的潜在靶蛋白与炎症相关基因的交集中，核心基因、核心通路都是炎症相关→细胞中苦参煎剂可以减少炎症因子释放。

一句话总结一下现在网络药理学发文的套路就是：常规网络药理学基础上在细胞上验证Hub基因的表达。就这么简单！

PS：研究中使用中药煎剂直接干预细胞的方法有待商榷，且不论中药煎剂PH、渗透压、离子浓度等的影响，光就网络药理学分析流程来说，用口服生物利用度、类药性筛出来的活性成分至少还是得用含药血清来干预才合理，本文作者运气不错，但是说不定我们这样做下来就被审稿人逮住枪决了…

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